AI 工具賦能學術研究

從文獻探勘到論文寫作,建立你的研究副駕駛系統

Vista Cheng(鄭緯筌)

Vista Cheng(鄭緯筌)

AI 應用培訓師|內容策略顧問|作家

20 年寫作與內容策略經驗,著作近 20 本。長期把 AI 工具串成研究與寫作的工作流,協助大學教師、研究生與企業專業人士把每一份素材變成可累積的知識資產。最新專案:Second Brain Lab、AI 內容產製工作坊、Vibe Coding 實戰工作坊。

今日議程

  1. 01

    一個新世界

    為什麼 2026 年的研究者必須懂 AI

  2. 02

    文獻探索四大工具

    Research Rabbit / SciSpace / Consensus / Perplexity

  3. 03

    個人化研究助理

    NotebookLM 與 Stanford STORM

  4. 04

    引文分析經典

    Publish or Perish 仍然不可取代的理由

  5. 05

    Claude Code 進階串接

    開源學術工具 + 你自己的研究流水線

01

為什麼研究者必須懂 AI

今天的研究現場

一個碩博生平均要讀 200–500 篇 paper 才能寫出一份像樣的文獻回顧;一位大學教師每年要追蹤 5–10 個關鍵字的最新文獻、消化 30–50 場學術會議錄影、回覆數百封學生信件。

與此同時,arXiv 每天上傳 1,000+ 篇預印本、PubMed 每年新增 150 萬篇論文。閱讀速度 vs 出版速度的差距,已經超過任何單一研究者能追上的範圍。

AI 不會取代研究者,但「會用 AI 的研究者」會逐步取代「不會用 AI 的研究者」——尤其在文獻盤點、跨領域整合、初稿撰寫、回應審稿意見這四個高耗時環節。

研究流程裡的四個高耗時節點

🔍

文獻探勘

從關鍵字 → 找到核心 paper → 找到引用網絡 → 找到研究缺口。
痛點:Google Scholar 只給清單,看不出脈絡。

📖

文獻理解

讀懂 PDF 裡的方法、結果、限制,並比對與你的研究的關係。
痛點:術語門檻高、跨領域看不懂。

🧠

證據彙整

回答「目前學界對 X 的共識是什麼?」「正反兩方各有哪些證據?」
痛點:易陷入單一作者觀點。

✍️

初稿與改稿

從段落結構、句子流暢度,到回應審稿意見的措辭。
痛點:非英語母語者尤其吃虧。

AI 不是寫論文的代筆,是替你把「重複勞動」拿掉,讓你把腦力留給只有人類研究者能做的判斷與洞察。

02

文獻探索:Research Rabbit

Research Rabbit 2025 新版:兔子洞迭代探索

  • 一句話定位

    免費的「視覺化文獻探勘」工具,2025 年完成自推出以來最大改版,重做 UI 並引入「兔子洞」邏輯

  • 核心新概念

    迭代鏈接(Iterative Chaining):系統記錄你從一篇點到另一篇的路徑,形成可回溯的「探索路徑」,深挖文獻時不迷路

  • 語義相似性

    除了傳統引用網絡,新版加入語義分析(標題與摘要含義相似度),技術路徑與 Litmaps 對齊

  • 資料庫升級

    2025 新增數百萬篇論文,主要來自 Semantic Scholar 與 PubMed,總量超過 2 億篇

  • 網址

    www.researchrabbit.ai,註冊免費;2025 新增 Premium 付費版

新版五大核心能力

  • Seed Papers 啟動

    以 3–5 篇種子論文為起點,系統自動推薦 Earlier / Later / Similar Work

  • 自定義 X/Y 軸

    視覺化地圖坐標可自選(例:X 出版年份、Y 引用次數),快速找到特定時期的標竿研究

  • 顏色編碼分類

    不同 Collection 可用不同顏色,多專案並行也不會混淆

  • Timeline / Author Network 雙模式

    一鍵切換「論文時間演進」與「作者社交網絡」兩種視角

  • 高級篩選

    依年份、期刊權威性、特定作者快速收窄;Premium 版解鎖更深層關聯分析

5 步驟建立你的第一張文獻網絡

1

建立新 Collection

左側側邊欄點「New Collection」,命名格式建議:研究主題 + 年份(例:「生成式 AI 教學應用 2026」)

2

加入種子論文

點「Add Papers」,輸入標題、DOI 或關鍵字 → 選中論文按「Add to Collection」

3

啟動 Network View

在 Collection 介面點「Network View」,系統把論文轉成互動式知識圖譜(節點=論文、線條=引用關係)

4

用側邊欄擴張

依序點 Similar Work(找相似研究)、Earlier Work(追前人)、Later Work(看後續引用)

5

切換顯示模式

Network → Timeline 看時間演進;點作者啟用 Author Network 看領域核心研究者

視覺化地圖四大武器

🌐

Network View

互動式知識圖譜,節點=論文、線條=引用關係,可放大、拖曳、聚合。
用途:一眼看出研究群聚與孤島。

📅

Timeline 模式

把同一個 Collection 沿時間軸展開。
用途:釐清領域發展脈絡與典範轉移時刻。

👥

Author Network

以作者為節點建立社交網絡圖。
用途:找出領域核心研究者、潛在指導教授或合作對象。

📐

自定義 X/Y 軸

坐標軸自選(出版年份 × 引用次數、年份 × 主題密度)。
用途:挑出特定時期的標竿論文。

Zotero 整合與版本差異

  • Zotero Importer

    支援把 Zotero 文獻庫單向匯入 Research Rabbit,常用格式 BibTeX、RIS 都吃

  • 雙向即時同步

    舊版有的「即時雙向同步」官方表示正在重新開發中,目前以手動匯入/匯出為主

  • 免費版(Free)

    提供基本文獻地圖、推薦、搜尋;對 95% 學生與研究生已經足夠

  • 付費版(Premium,2025 新推)

    解鎖更深層的文獻關聯分析、進階搜尋、團隊協作工作流

  • 官方更新說明

    想看完整改版資訊與 Zotero 整合進度,到 www.researchrabbit.ai 的官方更新頁面追蹤

✍️ Practice

練習 ① Research Rabbit 文獻網絡

  1. 1 替你目前的研究主題建立第一張兔子洞探索路徑
  2. 2 建立新 Collection(命名:你的研究主題 2026),加入 3 篇你最熟、最敬重的核心論文當種子。
  3. 3 進 Network View → 點 Similar Work,找出 2 篇你之前沒聽過、但看標題就覺得「我應該讀」的 paper,加入 Collection。
  4. 4 切到 Timeline 模式看時間演進,再切到 Author Network 找出該領域的核心 3 位研究者;最後試試自定義 X/Y 軸(X=年份、Y=引用次數),挑出該領域近 5 年最具影響力的 1 篇。
⏱ 10 分鐘 📎 www.researchrabbit.ai、3 篇種子論文

03

文獻理解:SciSpace

SciSpace 是什麼?

  • 官方定義

    原名 Typeset,定位是「AI Copilot for Researchers」——專為論文設計的閱讀與寫作助理

  • 核心能力

    上傳 PDF 後,可以針對任何段落「Explain(解釋)」「Summarize(摘要)」「Find related papers(找相關文獻)」

  • 資料規模

    索引超過 2.7 億篇論文,可跨論文問問題

  • 特殊場景

    對非母語英文閱讀者特別友善——一鍵把方法段落翻成繁中+白話解釋

  • 網址

    scispace.com,免費版每月有額度限制;學術機構可申請進階方案

SciSpace 七個常用功能

📄 PDF Copilot 上傳論文,旁邊會出現可問答的側欄
🔍 Literature Review 輸入研究問題,自動產出文獻回顧表格
💬 Explain Math 對著公式按右鍵,要求白話解釋
📊 Compare Papers 一次比較多篇論文的方法、結果、結論
📝 AI Detector 檢測一段文字像不像 AI 寫的
✍️ Paraphraser 改寫段落,避免抄襲爭議
🌐 Translate 段落即時翻譯,保留學術術語
📑 Citation Generator 自動產出 APA/MLA/Chicago 等格式

SciSpace 經典工作流:理解一篇陌生領域論文

1

上傳 PDF 到 SciSpace

可直接拖曳,系統自動 OCR 並建立段落索引

2

用 Copilot 問三題

「這篇的核心貢獻是什麼?」「方法的限制?」「跟我的研究有何關聯?」

3

對方法段落用 Explain

請它把統計方法或實驗設計用「研究生第一年也聽得懂」的方式解釋

4

用 Find related papers

找出這篇的後續研究,確認它的觀點是否還是 SOTA

5

儲存問答到筆記

把有用的對話標星收藏,之後寫文獻回顧直接複用

04

證據彙整:Consensus

Consensus 是什麼?

  • 官方定義

    「用 AI 從科學論文中找答案」的搜尋引擎,主打「給你共識,不給你噪音」

  • 核心特色

    輸入問句(不是關鍵字),系統會直接回答「目前學界主流共識是什麼」

  • 視覺呈現

    Consensus Meter(共識計量器):用紅/黃/綠呈現支持、混合、反對的論文比例

  • 資料來源

    索引 2 億+ 篇 peer-reviewed 論文,過濾掉 predatory journal

  • 網址

    consensus.app,免費版每月 20 次查詢;Pro 版約 USD 8.99/月

Consensus vs Google Scholar:不同問題用不同工具

Google Scholar 適合

  • 找特定論文:已知作者或標題的精確檢索
  • 追蹤被引用:Cited by 一鍵看引用數
  • 免費下載:常能找到 PDF 連結
  • 歷史文獻:收錄年代久遠的經典文獻
  • 全領域通用:人文、社科、自然全都收

Consensus 適合

  • 是非判斷題:「X 對 Y 有效嗎?」直接給共識
  • 跨論文整合:一頁回答來自 10+ 篇論文的綜合判斷
  • 新手友善:不用會下複雜的搜尋語法
  • 品質過濾:已過濾低品質與 predatory 期刊
  • 視覺化證據:Consensus Meter 一眼看懂方向

Consensus 經典問句範例

PROMPT
輸入時用完整的問句,避免關鍵字組合:

「Does mindfulness meditation reduce anxiety in nursing students?」
「What are the long-term effects of intermittent fasting on cardiovascular health?」
「Is AI chatbot effective for mental health support in adolescents?」
OUTPUT
Consensus 會給你:
• 一段 AI 整理的綜合答案(含論文引用編號)
• Consensus Meter(綠:支持 / 黃:混合 / 紅:反對 的論文比例)
• 5–10 篇相關論文的標題、作者、年份、結論摘要
• 可一鍵切到「只看 Meta-analysis 與 RCT」高品質證據

05

個人化研究助理:NotebookLM

NotebookLM 為什麼適合學術場景?

  • 只讀你給的資料

    ChatGPT 用全網路知識回答;NotebookLM 只用你上傳的 paper、講義、訪談逐字稿

  • 每個回答都附引註

    可一鍵跳回原文段落——這對學術 fact-check 至關重要

  • 容量驚人

    單一筆記本最多 50 份來源、累計 2,500 萬字,足以裝下整篇博士論文的所有引用文獻

  • 資料隱私

    Google 官方明確聲明:你的個人筆記本內容不會被用於模型訓練

  • 多種輸出格式

    簡報、心智圖、學習指引、語音摘要 Podcast、影片摘要——選最適合你大腦的

研究者最常用的四種 NotebookLM 用法

📚

文獻回顧加速器

一次丟 30–50 篇 paper,請它整理研究缺口表、方法比較表、共識與爭議分布。
預期:原本 2 週的初步盤點,3 小時完成。

🎙️

Audio Overview 通勤學習

把整個主題的關鍵 paper 變成 15 分鐘 AI 雙人對談,戴耳機通勤聽。
預期:把死時間變成深度學習。

🧪

Method 段落專家化

把同一統計方法的不同教科書與 paper 都丟進來,問「這個情境該用哪個 test?」
預期:得到帶引註、可信度高的方法建議。

🗂️

萬物筆記本(Steven Johnson 心法)

一份「所有領域核心參考」的筆記本,跨研究主題隨時可問。
預期:知識能跨年度累積,不再每次重起爐灶。

NotebookLM 學術研究 5 步驟工作流

1

依研究問題建立筆記本

命名格式:「主題 + 階段」,例如「正念介入護理生焦慮(文獻盤點)」

2

上傳分層素材

核心 5–10 篇必讀 paper + 10–20 篇延伸 + 1–2 本教科書的相關章節

3

先看 NotebookLM 自動建議的問題

比你硬想要問什麼更快進入材料的核心

4

用 Audio Overview 聽 15 分鐘

通勤、運動時聽兩位 AI 主持人替你串講,回家直接寫初稿

5

把對話存成筆記,匯出大綱

所有有用的問答都儲存;最後請它產出文獻回顧大綱草稿

把 NotebookLM 想成你 24 小時待命的「博士後研究員」——他讀完了你給的所有 paper,隨時可問、絕不亂掰、會引用原文。

06

即時研究助手:Perplexity AI

Perplexity AI 是什麼?

  • 官方定義

    「答案引擎」——介於搜尋引擎與 AI 對話之間的混合體,每個答案都附即時引用

  • 核心差異

    ChatGPT 只給答案;Perplexity 給答案 + 來源連結 + 可追問

  • Academic 模式

    專屬學術搜尋模式,只搜 peer-reviewed 來源(Pro 版本可選)

  • Pro Search 功能

    會先拆解你的問題、規劃搜尋策略、再多輪檢索整合

  • 網址

    perplexity.ai,免費版每天 5 次 Pro 搜尋;Pro 版 USD 20/月

Perplexity vs ChatGPT:什麼時候該用哪個?

用 ChatGPT 適合

  • 腦力激盪:討論研究方向、概念、隱喻
  • 寫作與改稿:段落改寫、語氣調整、結構建議
  • 翻譯與詞彙:中英對譯、學術用語選擇
  • 程式與計算:統計腳本、實驗模擬、資料處理
  • 長對話:需要記得前後脈絡的多輪討論

用 Perplexity 適合

  • 查事實:需要可驗證來源的具體事實
  • 查最新研究:2024 年後的新資訊、新論文
  • 查時事:AI 發展、政策、產業動向
  • 查健康/醫療:需要嚴謹引用的臨床建議
  • 寫文獻段:需要立刻附上引用連結的研究背景

Perplexity 學術研究 3 個高效用法

PROMPT
① 切到 Academic 模式(漏斗圖示):
「Latest evidence on AI literacy education for nursing students 2024-2026」

② 用 Focus + 自訂域名:
限定 pubmed.ncbi.nlm.nih.gov,搜尋特定主題

③ Perplexity Spaces(共享筆記本):
建立研究主題 Space,所有對話自動歸檔

④ Pro Search 多輪檢索:
問「比較三種介入方式對護理生焦慮的成效,並列出最近 5 年最有力的 RCT」
OUTPUT
回應會包含:
• 結構化答案(含小標)
• 每段事實後標註 [1][2][3] 連結
• 右側「Sources」面板列出所有引用論文
• 底部「Related」推薦下一步可問的問題
• 可一鍵匯出為 PDF 或分享給研究團隊

07

學術文獻與引用分析軟體:Publish or Perish

Publish or Perish 為什麼還沒被取代?

  • 作者背景

    Anne-Wil Harzing 教授(學術計量專家)2006 年起免費維護的桌面軟體

  • 核心能力

    從 Google Scholar / Scopus / Web of Science / Crossref 抓取引文資料,計算 h-index、g-index 等指標

  • 特殊優勢

    比 Google Scholar 介面更強大的批次分析、排序、匯出功能

  • 關鍵用途

    評估期刊影響力、找出領域內被引用最多的 paper、檢視特定學者的學術生產力

  • 網址

    harzing.com/resources/publish-or-perish,Win/Mac/Linux 全平臺免費

Publish or Perish 四大典型應用

📊

評估期刊影響力

輸入期刊名稱,看近 5 年發表論文的平均引用數、h-index。
用途:投稿前評估期刊真實影響力。

🏆

找領域奠基論文

輸入關鍵字,按引用數排序,找出整個領域被引用最多的 10 篇。
用途:文獻回顧必讀清單。

👨‍🏫

研究學者背景

輸入學者名字,看其完整發表清單、總引用數、h-index、近年活躍度。
用途:找指導教授、合作對象、評審。

🌍

跨資料庫比較

同一個查詢同時跑 Google Scholar 與 Scopus,看引用數差異。
用途:學位論文、評鑑報告引用。

08

「多專家」視角的 AI 研究助理:Stanford STORM

STORM 是什麼?

  • 全名

    Synthesis of Topic Outlines through Retrieval and Multi-perspective Question Asking

  • 出身

    Stanford OVAL Lab 開源專案,2024 年釋出論文與程式碼

  • 核心能力

    輸入主題 → AI 自動扮演多種視角的研究者來回問答 → 產出維基百科等級的長篇文章

  • 特殊設計

    會主動「站在不同利害關係人立場」提問,避免單一視角偏見

  • 使用方式

    線上版 storm.genie.stanford.edu(免費註冊);進階使用者可自架(GitHub: stanford-oval/storm)

STORM 5 步驟產出研究主題長文

1

到 storm.genie.stanford.edu 註冊

用 Google 帳號登入,免費

2

輸入研究主題

可寫成題目或一段背景描述,越具體越好

3

STORM 自動規劃

它會先列出大綱、再扮演不同 perspective 的研究者互相問答

4

等待 5–10 分鐘

會即時顯示對話過程,可看 AI 怎麼「自我研究」

5

取得長文 + 引用

產出維基百科風格的長文(3,000–8,000 字),每段附來源連結

STORM 不是給你最終投稿稿,是給你一份「我從來沒接觸過這個主題,但需要 30 分鐘建立全貌」時最快的 first draft。

09

Claude Code 進階:開源學術工具

為什麼要用 Claude Code 串接開源工具?

前面介紹的 7 個工具都是「現成 SaaS」——介面友善、上手快,但你被綁在它的功能與價格裡。

Claude Code(Anthropic 官方 CLI)是一個會寫程式、會自動執行任務的 AI 終端機。它能直接 git clone GitHub 上的開源學術工具,幫你跑、幫你改、幫你串成專屬流水線。

只要你願意花一個下午學基本指令,就能擁有一個「24 小時待命、可不斷進化、不被任何 SaaS 漲價綁架」的研究流水線。同樣的邏輯也適用於 OpenAI Codex CLI——兩者都能讀取本地檔案、執行 shell 指令、迭代修改程式。

安裝 Claude Code 三步驟(免寫程式背景)

  • 前置:裝好 Node.js 18+

    到 nodejs.org 下載安裝包,一鍵安裝

  • 打開終端機,執行

    `npm install -g @anthropic-ai/claude-code`

  • 登入 Anthropic 帳號

    在任何專案資料夾打 `claude`,跟著畫面登入即可

  • 第一句話可以問

    「請幫我把這個資料夾整理一下」——觀察它怎麼讀檔、規劃、執行

  • 進階

    裝 OpenAI Codex CLI 作為第二意見:`npm install -g @openai/codex`

工具 ① dzhng/deep-research

  • GitHub

    github.com/dzhng/deep-research(4 萬+ stars)

  • 一句話描述

    一個 TypeScript 寫的「深度研究 agent」——給它一個主題,它會自己規劃、搜尋、迭代、產出報告

  • 核心特色

    可自訂搜尋深度(depth)與廣度(breadth),預設用 OpenAI 模型但可換成 Claude

  • 典型用法

    「給我一份關於 AI 在護理教育應用的 30 頁文獻盤點,深度 3 層、廣度 5 個子題」

  • Claude Code 串接

    請 Claude Code 幫你 clone repo、改成用 Claude API、跑出第一份報告

Claude Code 一鍵啟動 deep-research

PROMPT
在終端機打開 Claude Code,貼這段給它:

「請幫我做以下事情:
1. clone github.com/dzhng/deep-research 到 ~/research-tools/
2. 安裝依賴 npm install
3. 設定 .env 用我的 Anthropic API key(claude-sonnet-4-6)
4. 跑一份主題:『正念介入對護理生焦慮的成效』,depth 3、breadth 4
5. 結束後把報告存到桌面的 nursing-mindfulness-report.md」
OUTPUT
Claude Code 會:
• 自動 git clone 並 cd 進去
• 跑 npm install,遇到錯誤會自己嘗試修
• 讀 .env.example,複製成 .env,引導你貼 API key
• 改 src/providers.ts 把 OpenAI 換成 Anthropic(如果你說要)
• 執行 npm run start 並餵入你的主題與參數
• 產出後把 markdown 移到桌面,並告訴你下一步建議

工具 ② wshuyi/deep-research(中文 Claude Code Skill)

  • GitHub

    github.com/wshuyi/deep-research(中文 README 完整、學術導向)

  • 一句話描述

    一個 Claude Code Skill,把模糊主題用「8 步系統化方法論」轉成可交付、可追溯的調研報告

  • 資料分層

    L1 官方文件 > L2 部落格 > L3 媒體 > L4 社群——強制把每個事實標註來源層級

  • 獨立校驗(v2.1 新增)

    Step 6.5 啟動獨立 Agent 在報告產出前重新核對事實與推理鏈,避免幻覺

  • 典型場景

    寫 literature review、技術選型對比、跨領域文獻盤點、回應審稿意見前的證據準備

安裝與啟動 wshuyi/deep-research

PROMPT
安裝(任一方式):

方式 1:git clone
  git clone https://github.com/wshuyi/deep-research.git
  cp -r deep-research/skills/deep-research ~/.claude/skills/

方式 2:plugin marketplace
  /plugin marketplace add wshuyi/deep-research
  /plugin install deep-research@wshuyi/deep-research

啟動(自然語言觸發):
  「深度調研:正念介入對護理生焦慮的成效」
  「對比分析 RCT 與單組前後測在護理介入研究的適用情境」
OUTPUT
會自動跑 8 步流程:
  Step 0   問題類型判斷
  Step 0.5 時效敏感性評估
  Step 1   問題拆解
  Step 2   資料分層 L1–L4
  Step 3   事實卡片(每條附來源)
  Step 4   對照框架
  Step 5   參照基準
  Step 6   推導鏈
  Step 6.5 獨立 Agent 校驗(BLOCKING)
  Step 7   用例驗證
  Step 8   交付化處理

產出落在 ~/Downloads/research/<topic>/:問題拆解、資料來源、事實卡片、對照框架、推導過程、校驗紀錄、最終報告

工具 ③ labarba/sciwrite

  • GitHub

    github.com/labarba/sciwrite(Lorena A. Barba 教授維護)

  • 作者背景

    George Washington University 機械工程教授,學術寫作教學經典課程作者

  • 一句話描述

    一份結構化的「科技論文寫作品質檢查清單」——可當 prompt 餵給任何 LLM 改稿

  • 核心檢查項

    句子結構、被動語態、冗餘字詞、轉折詞濫用、段落主題句、術語一致性

  • Claude Code 用法

    把你的 paper draft 與 sciwrite 規則一起餵給 Claude Code,請它逐段審閱

Claude Code 跑 sciwrite 改稿流程

PROMPT
在你的論文資料夾打開 Claude Code,貼這段:

「請幫我做:
1. 從 github.com/labarba/sciwrite 抓最新的 writing rules(在 README 與 docs/ 底下)
2. 讀我這個資料夾下的 introduction.md
3. 依 sciwrite 的 5 大原則(clarity、concision、active voice、keyword consistency、no clutter)逐段審閱
4. 對每段給:原句 → 問題 → 建議改寫 → 改寫理由
5. 把結果存成 introduction-review.md」
OUTPUT
你會收到:
• 逐段對照表格
• 標出哪些句子過長(>30 字)、哪些用了被動式但可改主動
• 重複出現但意思相同的詞(如 utilize / use / employ 三選一)
• 段落主題句是否在第一句出現
• 整體 readability 評分與優先修改建議
• 可進一步問:「請直接幫我改寫第 3 段並保留原意」

工具 ④ futurehouse/paper-qa

  • GitHub

    github.com/Future-House/paper-qa(FutureHouse 開源)

  • 一句話描述

    專為科學文獻設計的「高準確 QA 系統」——只回答有引用支撐的問題,會主動說「我不知道」

  • 核心優勢

    對比 ChatGPT,幻覺率極低;論文比對指出在科學問答上勝過商用 GPT-4

  • 典型用法

    丟一個資料夾的 PDF,問「這些 paper 對 X 的共識是什麼?」

  • Claude Code 串接

    請 Claude Code 幫你裝 Python 環境、灌一批 PDF、跑批次問答

工具 ⑤ assafelovic/gpt-researcher

  • GitHub

    github.com/assafelovic/gpt-researcher(22k+ stars)

  • 一句話描述

    另一個自主研究 agent,比 deep-research 更早、生態更完整

  • 特色 1

    內建多種報告格式:detailed report、resource report、outline report

  • 特色 2

    支援 LangChain,可整合到更大的研究流水線

  • Claude Code 用法

    請 Claude Code 幫你架起來,並改成用本地 Ollama 跑 Llama 3.3 完全免 API key

Claude Code / Codex 的 5 個學術小工具

📄 microsoft/markitdown 把 PDF / Word / Excel / PPT 全轉成乾淨 Markdown,餵給 LLM
🌐 jina-ai/reader r.jina.ai 把任何網頁變成乾淨 markdown,免登入免 API
📚 arxiv-mcp-server MCP server,讓 Claude Code 直接查 arXiv 並下載 PDF
🔬 semantic-scholar-mcp MCP server,查 2 億+ paper,含引用網絡
🧪 openai/openai-agents-python OpenAI 官方 agent 框架,可建研究小組

進階:把多個工具串成研究流水線

  • Step 1:靈感階段

    Perplexity 或 Consensus 查最新證據 → 鎖定研究問題

  • Step 2:盤點階段

    Research Rabbit 視覺化網絡 → 匯出 50 篇核心 paper(BibTeX)

  • Step 3:理解階段

    paper-qa + NotebookLM 雙線:前者跑批次問答,後者做主題對話

  • Step 4:撰寫階段

    STORM 產初稿大綱 → Claude Code 用 sciwrite 規則逐段改寫

  • Step 5:投稿階段

    Publish or Perish 評估期刊 → SciSpace 產對應期刊格式

10

研究倫理與實作建議

AI 進入學術,必須守住的五條紅線

  • 1. AI 不能列為作者

    Nature、Science、JAMA 等頂刊都明確禁止;AI 只能是工具

  • 2. 必須揭露使用情形

    投稿前看期刊規範,多數要求在 Methods 或 Acknowledgements 揭露

  • 3. 引用一定要回查原文

    AI 偶爾會編造看似真實的引用——務必到原始期刊頁面驗證

  • 4. 敏感資料不上雲

    個資、未發表臨床資料、競爭性資料,避免上傳到非機構審核的工具

  • 5. 結果你要負責

    AI 可以提建議,但所有判斷、結論、引用的正確性最終都是你的責任

核心原則:AI 是「研究助理」不是「研究代理人」。任何能讓你說出「這是我的研究」的環節,都必須由你親自把關。
✍️ Practice

練習 ② 設計你的 30 天 AI 研究升級計畫

  1. 1 挑 3 個今天介紹的工具,排出 30 天的學習與整合順序
  2. 2 第 1 週:先從最低門檻的 Perplexity + Research Rabbit 開始,每天用 30 分鐘替你的研究主題建立文獻地圖。
  3. 3 第 2 週:把核心 30 篇 paper 灌進 NotebookLM,每天用 Audio Overview 通勤聽 15 分鐘。
  4. 4 第 3 週:學會 SciSpace + Consensus 的高效查詢,產出第一份文獻回顧草稿。
  5. 5 第 4 週:嘗試裝 Claude Code,跑一次 sciwrite 改稿;下個月開始嘗試 deep-research、paper-qa 自架流水線。
⏱ 15 分鐘 📎 你的研究主題、紙筆、行事曆

11

資源、社群、下一步

本次介紹的所有工具,一次收齊

🐰 Research Rabbit www.researchrabbit.ai
🔭 SciSpace scispace.com
📊 Consensus consensus.app
📓 NotebookLM notebooklm.google.com
💬 Perplexity perplexity.ai
📈 Publish or Perish harzing.com
🧠 Claude Code claude.com/claude-code

Vista 的延伸學習資源

從今天起,把 AI 變成你的研究副駕駛

工具會繼續換代,但「結構化思考 × 系統化收斂 × 個人化累積」的方法不會過時。今天動手做,就是建立你研究系統的開始。

📣 邀請 Vista 到您的單位授課
歡迎各大學、企業、公部門邀請演講與工作坊:AI × 學術研究與寫作、AI 內容產製、Vibe Coding、知識管理系統、第二大腦工作流

🎤
課程與演講官網
vistacheng.com|邀約、課程、著作、媒體露出一覽
📥
免費下載|AI 學術寫作指南
vista.tw/ai-academic-writing
📚
學術寫作文章索引
vista.tw 學術寫作標籤頁,持續更新

📩 iamvista@gmail.comVista Cheng|歡迎來信討論合作